Hrvatske željeznice prestale su djelovati kao jedinstveno poduzeće, a umjesto jedinstvenog HŽ-a, nacionalni željeznički prijevoznik podijeljen je na pet zasebnih trgovačkih društava – HŽ Putnički prijevoz, HŽ Cargo, HŽ Vuča vlakova, HŽ Infrastruktura i HŽ Holding. Zadnji dan dosadašnjega trgovačkoga društva Hrvatske željeznice bio je 29. prosinca, kad je HŽ-u stiglo rješenje Trgovačkog suda o gašenju HŽ-a i upisu u sudska registar pet novih društava.
Od novih društava, najviše zaposlenika, njih 7.533, bit će u HŽ Infrastrukturi, društvu za upravljanje, održavanje i izgradnju željezničke infrastrukture, HŽ Putnički prijevoz imat će 1.253 zaposlenika, HŽ Cargo za prijevoz tereta njih 2.573, HŽ Vuča vlakova 2.158 zaposlenika, a HŽ Holding, društvo za poslovne usluge, 235 zaposlenika. U HŽ-u očekuju da će se nova društva, ponajprije Putnički prijevoz i Cargo, maksimalno orijentirati na korisnike, kao i da će pozitivno poslovati. Trgovačko društvo Vuča vlakova, kao interni dobavljač usluga Putničkom prijevozu i Cargo trebalo bi biti troškovno efikasno, a jedinstveno funkcioniranje sva četiri društva osigurat će se kroz društvo HŽ Holding. Sva društva na taj način dočekat će spremno liberalizaciju tržišta koja će nužno racionalizirati poslovanje društava, navode iz HŽ-a.
Prema ranijim najavama iz HŽ-a, u 2006. se očekuje ukupni prihod u iznosu 3,8 milijardi kuna, a rashodi se planiraju u iznosu 3,6 milijardi kuna, pa se očekuje pozitivan financijski rezultat od oko 200 milijuna kuna. U strukturi ukupnih prihoda prihodi iz državnog proračuna iznose 2,2 milijarde kuna, što je 3,6 posto manje u odnosu na 2005., a ostalo su vlastiti prihodi HŽ-a.