Iako ne postoji Pravilnik o PDV-u za putničke agencije, niti je u službenim glasilima objavljen Zakon o naplati PDV-a za jednodnevne izlete u inozemstvo, četiri putničke agencije u Istarskoj i Primorsko-goranskoj županiji dužne su platiti više od 12 milijuna kuna PDV-a. Žalbe koje su uložile agencije Kompas Rabac, Atlas Rabac, Da Riva i Kompas Travel iz Poreča na odluku Porezne uprave drugostupanjski sud je odbio i tereti ih za neplaćeni porez koji nijedna druga putnička agencija u Hrvatskoj ne mora plaćati.
Porezna uprava poziva se na mišljenje iz 1998. godine prema kojemu bi putničke agencije trebale plaćati porez na jednodnevne izlete preko granice, ali to je mišljenje Ministarstva financija u nekoliko navrata odbacilo i vratio novac oštećenim agencijama nakon više mjeseci, i to bez kamata. Nepostojanje Pravilnika otvorilo je poreznim inspektorima mogućnost slobodne procjene te su oni zbog pravne neizvjesnosti doveli u teške situacije putničke agencije koje su bile prisiljene zatvoriti svoja vrata i dospjele su u stečaj, iako neke imaju potpisane ugovore s vodećim inozemnim turoperatorima. Iako je Ministarstvo turizma podržalo putničke agencije, ravnatelj PU-a Ivica Mladineo tvrdi da su porezni inspektori postupili ispravno.
- Na mišljenje iz 1998. godine odgovoreno je da je agencija obvezna obračunati porez na dodanu vrijednost na naknadu primljenu za jednodnevne izlete prema stopi od 22 posto sukladno odredbama Zakona o porezu na dodanu vrijednost. U tom dijelu Zakon o porezu na dodanu vrijednost dosad se nije mijenjao, a propisuje da se mjestom obavljanja usluga smatra sjedište poduzeća koje obavlja usluge ili mjesto na kojem se usluge stalno obavljaju – tvrde u Poreznoj upravi.
To bi značilo da se, iako se usluga obavlja u inozemstvu, tereti sjedište tvrtke u Hrvatskoj, što je klasičan primjer dvostrukog oporezivanja. Zemlje Europske unije izbjegavaju dvostruko oporezivanje i ne plaća se porez za jednodnevne izlete u inozemstvo jer se gotovo cjelokupna usluga (osim prijevoza do granice) vrši u inozemstvu, gdje je već oporezivana prema stopi PDV-a koji vrijedi u zemlji izvršenja usluge.
- Stručno je neprihvatljivo da se agencije dvostruko oporezuju. Posebice ako isti zakon ne vrijedi za prijevoznike. Ministar Božidar Kalmeta obaviješten je o cijelom slučaju i sazvao smo sastanak s ravnateljem PU-a Ivicom Mladineom i vodstvom UHPA-e, na kojemu smo jasno iznijeli svoj stav da se PU mora očitovati i da ne smije nekim agencijama naplaćivati porez, a druge kažnjavati. Uklanjanjem nulte stope za agencije nisu jasno definirana pravila o oporezivanju i zbog toga dolazi do problema. Slučajevi su trenutačno u fazi rješavanja i čekamo izjavu PU-a – istaknuo je državni tajnik za turizam Zdenko Mićić, dodajući da se tržište čim prije mora izjednačiti jer nije logično da se prijevoznici oporezuju samo do hrvatske granice, a da se putničkim agencijama s vlastitim prijevozom naplaćuje porez i u Hrvatskoj i u inozemstvu.
Porezna uprava prije sedam godina teretila je Kompas Travel iz Poreča za istu stvar, agencija je platila 300 tisuća kuna, koje su joj 2001. godine vraćene jer je utvrđena greška. Pet godina kasnije agenciji je stiglo rješenje da mora platiti porez na jednodnevne izlete unatrag tri godine, koji iznosi oko 10 milijuna kuna, a agenciji vrlo vjerojatno predstoji bankrot. Za izlete u Veneciju Kompas Travel prevozio je putnike vlastitim brodom kojim je uveden u linijski prijevoz s kartama Jadrolinije, ali i za tu su uslugu agenciju teretili za plaćanje PDV-a unatrag dvije godine, iako je riječ o linijskom prijevozu. Prema toj logici i Jadrolinija bi trebala plaćati porez na relaciji Split-Ancona, a ne plaća ga. Ako prijevoznik Autotrans, koji je među ostalim registriran i kao putnička agencija, ne plaća PDV u inozemstvu, prema istoj logici ni Kompas, koji u djelatnosti ima i prijevoz, ne bi trebao plaćati porez za usluge u inozemstvu.