Najviše koristi od SEPA-e imaju internacionalne kompanije s podružnicama u više država korisnica sustava, koje će moći na jednostavniji način obavljati plaćanja između svojih filijala.
Svaka zemlja u Europskoj uniji ima svoj platni sustav, pravni okvir i tehničke standarde. Sa SEPA-om će se riješiti upravo taj problem, te će građanima, poduzećima, ali i javnim institucijama biti jednostavnije, sigurnije i efikasnije koristiti se jedinstvenim sredstvima i načinima plaćanja. SEPA će omogućiti potrošačima da obave bezgotovinsko plaćanje bilo kome unutar SEPA zone koristeći se jednim bankovnim računom i jednim setom platnih instrumenta. Isto se odnosi i na poduzeća, naročito ona koja imaju svoja predstavnstva u drugim zemljama.
Sva plaćanja obavljat će se u jedinstvenoj valuti – euru, a zemlje koje su u prijelaznom razdoblju ili unutar svojih platnih sustava ne koriste euro kao isključivo sredstvo plaćanja (Velika Britanija, Norveška i netom priljene nove članice) neće moći u potpunosti iskoristiti sve mogućnosti novog sustava, budući da će transakcije morati biti konvertirane u euro.
Dobrobiti takvoga jedinstvenog sustava za bezgotovinska plaćanja (način gotovinskih plaćanja unificiran je još 2002.) neće biti vidljive za hrvatske građane, koji plaćanja još neko vrijeme neće obavljati preko SEPA-e, ali oni koji bi mogli imati nekakve koristi su internacionalne kompanije s podružnicama u više država korisnica sustava, koje će moći na jednostavniji način obavljati plaćanja između svojih filijala.
Direktna korist u budućnosti mogla bi se ogledati u mnogo jednostavnijem prelasku na SEPA-u kada jednog dana uđemo u Europsku uniju.