Ako se za manjak tereti odgovorna osoba, od nje se potražuje vrijednost manjka uvećana za PDV. Ali upravni ili nadzorni odbor može nastati manjak smatrati nepriznatim rashodom tvrtke, što znači samo obvezu plaćanja 20 posto poreza na dobit.
Oslovni subjekti obvezni su bar jedanput na godinu popisati svu imovinu i obveze kako bi provjerili točnost podataka u svojim poslovnim knjigama i knjigovodstvene evidencije uskladili sa stvarnim stanjem imovine u skladištima, trgovinama, uredima i svim drugim poslovnim prostorima. Obveza provođenja godišnjeg popisa (inventura) uređena je dvama zakonima – Zakonom o računovodstvu i Općim poreznim zakonom. Godišnji popis uvijek se izrađuje sa stanjem na 31. prosinca kao posljednjim danom poreznog razdoblja, iako se fizički obavlja neposredno prije ili nakon posljednjeg dana poreznog razdoblja. Čak su i poduzetnici koji dnevno ažuriraju stanje za liha obvezni na kraju poslovne godine kontrolirati i uskladiti knjigovodstveno sa stvarnim stanjem. Podaci o stanju imovine iskazuju se na tzv. popisnim listama i uspoređuju s podacima u knjigovodstvu poduzetnika. Ako podaci iz popisnih lista pokažu da je pronađena imovina koja nije evidentirana u poslovnim knjigama, ta se imovina uvodi u poslovne knjige. Viškovi ne podliježu plaćanju poreza, porezna obveza nastaje tek nakon što na inventuri pronađena imovina bude prodana ili na drugi način stavljenja u promet. Porezni učinci za poduzetnika mogu nastati ako se na inventuri utvrdi manjak kratkotrajne ili dugotrajne imovine. Pri tome porezni propisi razlikuju neoporezivi i oporezivi manjak imovine.
Manjak koji objektivno nastaje tijekom poslovnih aktivnosti smatra se poreznim dopuštenim manjkom, ali samo do određenog iznosa. Riječ je o gubicima koji se događaju kao posljedica tehnoloških procesa te o kalu, rastru i lomu koji nastaju pri manipuliranju dobrima. Iznosi dopuštenog manjka prema toj osnovi određeni su u petnaest pravilnika Hrvatske gospodarske komore i tri pravilnika Hrvatske obrtničke komore, pri čemu trgovačka društva i fizičke osobe obveznici poreza na dobit primjenjuju pravilnike koje je donijela gospodarska, a obrtnici obveznici poreza na dohodak pravilnike koje je donijela obrtnička komora. Pravilnicima određene količine poreznog su dopustiv manjak, ne podliježu ni plaćanju PDV-a ni poreza na dobit, odnosno poreza na dohodak.
U istom su poreznom režimu manjkovi proizvoda nastali zbog neodgovarajuće kvalitete, isteka roka trajanja, kvarova, lomova i sličnih razloga, ali samo ako je pri utvrđivanju činjeničnog stanja o količini i vrijednosti takvih neupotrebljivih proizvoda prisustvovalo službenik Porezne uprave. Ako nema očevindika kojem je prisustvovalo ovlašteni porezni službenik, ali poduzetnik raspolaže drugim ispravama, kao što je zapisnik nadležnog inspekcijskog tijela, Policijske uprave ili drugog ovlaštenog tijela mjerodavnog za procjenu štete, i tada su ispunjeni uvjeti da se manjak proizvoda nastao zbog nekih izvanrednih okolnosti smatra neoporezivim. Takvi su primjeri gubicija koji nastaju zbog požara, poplave, provalnih krađa i slično.