U razdoblju reprogramiranja teku kamate na glavnicu, ali prema nešto nižoj stopi od one zateznih kamata. Zaračunavaju se u visini kamatne stope na trezorske zapise uvećane za pet postotnih bodova.
U paketu novih poreznih propisa izmijenjen je Zakon o posebnoj mjeri naplate poreznog duga prouzročenog gospodarskom krizom, donesen početkom 2011. U skladu s novom koncepcijom užurbana raščišćivanja naraslih potraživanja poreznih tijela naziv propisa izmijenjen je u Zakon o mjerama naplate poreznog duga prouzročenog gospodarskom krizom. Prema izmijenjenom Zakonu, poduzetnicima su omogućene dvije mjere rješavanja poreznog duga: reprogramiranje otplate poreznog duga ili otpis kamata na porezni dug. Za obje mjere Zakon određuje vrlo kratke rokove za podnošenje zahtjeva. Poduzetnici koji se odluče koristiti mjerom reprogramiranja poreznih dugova moraju Poreznoj upravi podnijeti zahtjev u roku od 30 dana, a oni koji zatraže otpis kamata moraju podnijeti zahtjev u roku od 60 dana od stupanja na snagu izmijenjenog Zakona. Krajnji je rok za podnošenje zahtjeva za reprogramiranje duga 29. ožujka 2012., a za podnošenje zahtjeva za otpis kamata rok iste je 28. travnja. Poduzetnik može zatražiti reprogram poreznog duga ili otpis kamata, ali ne može podnijeti zahtjev za obje, nego samo za jednu od ponuđenih mogućnosti. Poduzetnik kojem je dug već reprogramiran može podnijeti zahtjev za otpis zateznih kamata.
Zahtjev za reprogram poreznog duga ili otpis kamata može podnijeti svaki poslovni subjekt koji ima dugove na osnovi poreza i doprinosa nastale do 31. siječnja 2012. Zahtjev ne mogu podnijeti financijske institucije, kreditne unije, investicijska društva, društva koja se bave osiguranjem, leasing-društva, institucije za platni promet ni institucije za e-novac. Da bi se zahtjev pozitivno riješio, nužno je da poduzetnik uredno podmiruje svoje obveze nastale nakon 31. siječnja 2012. Za poduzetnike koji su 2010. imali nepodmirene porezne obveze propisan je i dodatni uvjet – moraju dokazati da 2010. nisu isplatili dividendu i udjele u dobiti. Poduzetnik može od Porezne uprave zatražiti primjenu jedne od mjera za njegov ukupni dug nastao do 31. siječnja 2012. godine. Ukupni dug se sastoji od glavnice neuplaćenih poreza, trošarina i socijalnih doprinosa i od zateznih kamata za razdoblje dugovanja. Izmijenjenim Zakonom proširen je obuhvat javnih davanja za koje se mogu rabiti posebne mjere naplate. Prijašnji propis nije omogućavao reprogramiranje duga za doprinos za mirovinsko osiguranje generacijske solidarnosti. Prema izmijenjenom Zakonu isključena je mogućnost podnošenja zahtjeva za dug koji se odnosi na doprinos za mirovinsko osiguranje individualne kapitalizirane štednje (drugi mirovinski stup), ali može se zatražiti reprogram duga ili otpis zateznih kamata na neuplaćene svote doprinosa za mirovinsko osiguranje generacijske solidarnosti (prvi mirovinski stup).
