Nadan Vidošević istodobno je na čelu HGK, Upravnog odbora i Skupštine te daje suglasnost za odabir predsjednika županijskih komora.
Predsjedniku Komore mandat može prestati i prije roka na koji je izabran (četiri godine – do 2015., u petom uzastopnom mandatu) na vlastiti zahtjev ili razriješenjem prema odluci Skupštine.
Upravni odbor HGK čine: Nadan Vidošević (predsjednik), Zdenko Adrović (RAFFEISENBANK AUSTRIA, Zagreb), Božo Jusup (TANKERKOMERC, Zadar), Vlado Jerbić (DUROPACK BELIŠČE, Belišće), Marin Pucar (PODRAVKA, Koprivnica), Željko Mažuran (KORDUN, Karlovac), Zvonimir Radić (PIRAMIDA, Zagreb-Sesvete), Franco Palma (RIVIERA ADRIA, Žandar), Darko Petričević (VENTILATOR TVUS, Marija Bistrica).
Nadzorni odbor HGK predvodi Vinko Dumičić (POSLOVNO SAVJETOVANJE, Zagreb), a članovi su: Miljenko Baković (AUTOHRVATSKA, Split), Damir Skender (SAPONIJA, Osijek), Ivan Vanja Frančišković (CROATIA OSIGURANJE, Zagreb), Mijo Šimić (TEKSTILPROMET, Zagreb).
Nadzorni odbor (među ostalim) kontrolira materijalno i financijsko poslovanje Komore i raspolaže sredstvima Komore.
Skupština HGK bira predsjednika Komore na prijedlog Upravnog odbora. Predsjednik je Nadan Vidošević, a članovi su: Jerko Andrijić (RADEŽ, Blato), Dubravko Baričević (ZAGREBAČKI HOLDING, Zagreb), Nevenka Bečić (KERUM, Split), Tomislav Benić (TAMBURE BENIĆ, Čačinci), Mislav Bezmalić (SARDINA, Postira), Josip Bilandžija (BRESTOPAC, Garešnici), Josip Boban (AD PLASTIK, Solin), Zrinka Bokulić (LAGUNA NOVIGRAD, Novigrad), Ivan Brajković (MOST, Otočac), Arsen Brnčić (GRADENJE BRNČIĆ, Buzet), Luko Burilović (SLADORANA, Županja), Stjepan Car (KONCAR – INSTITUT ZA ELEKTROTEHNIKU, Zagreb), Ivica Čerovečki (KOTKA, Krapina), Pero Čosić (BRODSKA POSAVINA, Slavonski Brod), Drago Čugura (BILFINGER DURO BAKOVIĆ MONTAŽA, Slavonski Brod), Gordana Deranja (TEHNOMONT, Pula), Ivan Džaja (TROMONT, Split), Mladen Đedum (HTP OREBIĆ, Orebić), Martin Đurić (NARODNI TRGOVACKI LANAC, Soblje), Filip Filipč (TEHNIKA, Zagreb), Boris Garaj (HARTMANN, Koprivnica), Miljenko Goluban (STRAHINJICA, Zabok), Matijaž Gorup (DALEKOVOD, Zagreb), Branko Grašić (METTS, Čakovac), Veljko Grbac (ULJANIK, Pula), Nikola Gregur (PODRAVKA, Koprivnica), Katica Hauptfeld (KATARINA LINE, Opatija), Jardanka Ivčić (KRAS, Zagreb), Josip Jaguš (PETROKEMIJA, Kutina), Vladimir Jerbić (DUROPACK BELIŠČE, Belišće), Želimir Kodrić (SAMOBORKA, Samobor), Zlatko Koračević (HEP, Zagreb), Zoran Košćec (VARTEKS, Varaždin), Zlatko Kozina (TEKSTIL-LIO, Osijek), Edi Kučan (3. MAJ BRODGRADILIŠTE, Rijeka), Boleslav Kulaga (EXPORTDRVO, Zagreb), Pero Kulaš (ATLANTSKA PLOVIDBA, Dubrovnik), Julio Kuruc (PODRAVSKA BANKA, Koprivnica), Ivan Leko (C.I.A.K., Zagreb), Franjo Luković (ZAGREBAČKA BANKA, Zagreb), Alenka Malenica (DUKAT, Zagreb), Zlatko Meštrović (TRGONOM, Novi Marof), Lenko Milin (TANKERSKA PLOVIDBA, Zadar), Miro Mirković (KALI TUNA, Kali), Mira Mišković (REKORD, Osijek), Ivica Mudrinić (HT, Zagreb), Mario Müller (KANDIT, Osijek), Zlatko Navojec (SPAR, Bjelovar), Zvonimir Nemec (HEINEKEN ADRIA, Karlovac), Tihomir Orešković (PLIVA HRVATSKA, Zagreb), Goran Pajnić (BELJE, Đarda), Thomas Heinz Pandžić (ALLES, Požega), Hrvoje Patarac (ADRES GRUPA, Rovinj), Željko Pavlin (HS PRODUKT, Karlovac), Ante Pejković (MEMENTO SPALATO, Split), Damir Perić (TROKUT, Novska), Darko Perić (HZ INFRASTRUKTURA, Zagreb), Dragomir Perušić (BRODOKOMERC NOVA, Rijeka), Alan Premužak (HP – HRVATSKA POŠTA, Zagreb), Tihomir Premužak (VETROPACK STRAŽA, Hum na Sutli), Zdenko Prskalo (METALAC, Požega), Dario Puljiz (SPAČVA, Vinkovci), Goran Ražnjević (ILIRIJA, Biograd), Miljenko Raspahić (GAVRILOVIC, Petrinja), Stjepan Sabljak (KOKA, Varaždin), Davor Sabolić (ČATEKS, Čakovac), Dražen Sinko (KOMET, Prelog), Ivan Slamić (TVIN, Virovitica), Tedi Slamić (SLAMIC, Vrpolje), Krešimir Starčević (CROATIA OSIGURANJE, Zagreb), Rajko Stilinović (CROMING, Plitvica), Tomislav Thür (INA, Zagreb), Dujo Todorović (LANTEA GRUPA, Zagreb), Milan Travan (ISTARKA KREDITNA BANKA, Umag), Damir Vranić (ALSTOM HRVATSKA, Karlovac), Zrinka Vujčić (TLM, Šibenik), Sanja Vukelić-Karadžić (METALNA OPREMA, Senj).
