Do 2012. godine samo su obveznici koji PDV plaćaju prema naplaćenim naknadama bili obvezni do kraja veljače sastaviti konačni obračun, a obveznici koji PDV plaćaju prema zaračunanim isporukama imali su rok do kraja travnja. Novi Zakon o PDV-u to je promijenio.
Prema novom Zakonu o porezu na dodanu vrijednost, koji je na snazi od 1. srpnja 2013. godine, svi obveznici poreza na dodanu vrijednost dužni su do 28. veljače 2014. sastaviti i Poreznoj upravi predati konačni obračun PDV-a za 2013. godinu. Do 2012. godine samo su obveznici koji PDV plaćaju prema naplaćenim naknadama bili obvezni do kraja veljače sastaviti konačni obračun, a oni koji PDV plaćaju prema zaračunanim isporukama imali su rok do kraja travnja. Od 2013. za sve obveznike PDV-a krajnji rok za dostavljanje konačnog obračuna PDV-a je zadnji dan veljače. Obračun se sastavlja na obrascu PDV-K, čiji sadržaj je uređen propisima iz drugog polugodišta 2013. godine, a u njemu treba obuhvatiti podatke za cijelu 2013. godinu. Inače, za 2014. godinu primjenjivat će se novi obrasci, oni koji su propisani zadnjim izmjenama propisa o PDV-u iz prosinca 2013. godine. Svi obveznici PDV-a dužni su Poreznoj upravi dostaviti obrazac PDV-K u elektroničkom obliku, u sklopu sustava ePorezna. Više nema predaje u papirnatom obliku.
Godišnji obračun PDV-a za neke je obveznike PDV-a identičan sumi obveze za PDV i prava na pret porez iskazanih u 12 mjesečnih odnosno u četiri tromjesečna PDV obrasca, već ovisno o tome jesu li tijekom 2013. bili mjesečni ili tromjesečni obveznici. Razlike će se odnositi na moždibitne naknadno utvrđene pogreške u obračunu, na obveze prema osnovi inventurnih manjaka ako nisu bile iskazane u obračunu za prosinac 2013., na naknadno priljene ili dane popuste i smanjenja zbog ranijeg roka plaćanja, naknadno odobrene rabate na kupljenu količinu i druge ispravke izdanih i priljeneh računa. Pravila ispravljanja računa nisu se izmijenila i porezni obveznik može ispraviti svoju obvezu za PDV samo nakon što primi pisano obavijest da je njegov kupac za isti iznos ispravio pravo na pret porez.
Razlike između kumulativa mjesečnih/tromjesečnih obračuna i konačnog obračuna PDV-a dogodit će se i kod većine poreznih obveznika koji su tijekom 2013. godine osim oporezivih, obavljali i isporuke oslobodene PDV-a. Oni ostvaruju pravo na pret porez s ulaznih računa za nabavke koje koriste za oporezive isporuke, nemaju pravo na pret porez s ulaznih računa koji se odnose na nabavke namijenjene za oslobodene promete, a za nabavke koje se odnose i na oporezive i na oslobodene isporuke tijekom godine odbijali su pret porez na temelju izračunanog postotka učešća oporezivih u ukupnim isporukama prema podacima za 2012. godinu. To je cijele 2013. godine bio privremeni podatak, tek u konačnom obračunu za 2013. treba na temelju preciznih knjigovodstvenih podataka o ostvarenom prihodu utvrditi stvarno učešće oporezivih u ukupnim isporukama i na temelju tog podatka, ako postoje razlike, u PDV-K ispraviti iskorišteni pret porez.