Moguće rješenje kako identificirati nepoznate virusne pronašle su doktorice bioloških znanosti Dragomira Majhen i Andreja Ambriović Ristov iz Instituta ‘Ruđer Bošković’. ‘Virus Hunter’ njihovo je oružje iza prve crte obrane od patogenih virusa.
Lovkinje na potencijalno patogene virusne Dragomira Majhen i Andreja Ambriović Ristov, obje doktorice bioloških znanosti u Institutu ‘Ruđer Bošković’, pronašle su moguće rješenje kako otkriti nepoznate virusne. Ideja kako unaprijediti metodologiju identifikacije nepoznatih virusa iz uzoraka doktoricama je sinula u jeku jedne od zastrašujućih epidemija suvremenog društva koju je prouzročio smrtonosni virus ebole. Dakako, rezultat je to i stečenoga znanja, gomile pročitane literature i neposrednog iskustva u višegodišnjem radu na adenovirusima. Inicijativu kako iskoristiti znanje i osmisli nov komplet za otkrivanje nepoznatih virusa iz uzoraka preuzela je doktorica Dragomira Majhen. Pretpostavku ili koncept, način na koji se patogeni virusi potencijalno povezuju sa stanicom i zatim je iniciraju, prepoznati o kojoj je vrsti virusa riječ, uobličila je u projekt radnog naziva ‘Virus Hunter’. ‘Virus Hunter’ jest projekt koji se temelji na tome da je virus patogen ako inicira stanicu. Međutim, da bi je inicirao, prije toga mora se vezati uz nju. Mehanizam vezivanja poznat je znanstvenicima, a ja ga nastojim iskoristiti kako bih identificirala o kojoj je vrsti virusa riječ – kaže Dragomira Majhen.
Kao i sve velike i pametne stvari, tako je i ovaj detalj u mehanizmu vezivanja patogenog virusa uza stanicu zapravo vrlo jednostavan. Trebalo je imati samo dovoljno iskustva u radu s patogenim virusima i mudrosti za uočavanje detalja te ga vješto iskoristiti. Međutim, taj detalj ostaje profesionalna tajna, barem dok se metodologija ne pokaže uspješnom, a koncept otkrivanja ne komercijalizira. – U ovoj metodi ključna je izrada manca kojim bismo mogli uhvatiti patogene virusne iz uzorka te ih identificirati. Pristup koji želimo istražiti u ovome projektu, odnosno metodi, potpuno je nov, zato ne znamo što nas očekuje na tom putu. Na temelju dostupne literature i svojih prethodnih istraživanja pretpostavljamo da je uspješna izvedba lovac na virusu moguća, ali to treba eksperimentalno dokazati – objašnjava trenutačnu fazu istraživanja Majhen.
Riječ je, naime, o inovaciji isključivo utemeljenoj na znanju, i to u području znanosti koje je temeljito istraženo. Nova metoda, pokaže li se pretpostavka točnom, ne zahtijeva razvijanje posebne tehnologije detekcije, nego se oslanja na postojeću laboratorijsku opremu. – Najslofisticiraniji instrument koji u ovom konceptu rabimo jest spektrometar masa. S pomoću njega otkrivaju se peptidi, odnosno slijed aminokiselina u njima, a zatim se pretragom baza podataka može odrediti kojem proteinu peptidi pripadaju, što istodobno odgovara na pitanje koji se virus nalazi u uzorku – objašnjava Majhen i dodaje kako je zanimljivo i to da mogu pronaći i potpuno nove peptide koji potencijalno potječu od potpuno nepoznatih virusa, što bi onda dalo posla drugim znanstvenicima da otkriju o čemu je riječ. Otkrivanje novih virusnih patogena, bilo da su nastali prirodno bilo da je riječ o biološkom oružju, ključno je za zdravlje i sigurnost svake države, pa tako i Hrvatske. Stoga je pretpostavka kako bi inovacija vrlo brzo našla komercijalnu primjenu.
Iako se čini da na odgovor na to pitanje ima mnogo tehnoloških rješenja, na tržištu nema dovoljno brze i osjetljive metode koja bi ciljano identificirala patogene virusa, bilo za čovjeka bilo za životinje, i to prije nego što izbijne infekcije – kaže znanstvenica.
Laički objašnjenje, postojeći komplet za identifikaciju virusa funkcionalna tako da s pomoću mamca iz uzorka ‘upecate’ virus čiji se proteini zatim sekvencioniraju u masnom spektrometru. Taj stroj znanstveniku izlista slijed aminokiselina specifičan za pojedinu vrstu virusa. S pomoću tih podataka lako je utvrditi koji je od poznatih virusa, čiji su sljedovi aminokiselina već poznati znanstvenicima, u uzorku koji ste analizirali. Međutim, nalazi li se u tom uzorku virus nepoznatog slijeda aminokiselina, imate problem, ne znate o kojoj je vrsti riječ. Upravo to nastoji promijeniti Dragomira Majhen, i to koristeći spoznaje o načinu na koji se taj virus povezuje sa stanicom.
Koliko znam, a kolegica dr. sc. Andreja Ambriović Ristov i ja doista smo se potrudile pretražiti svu dostupnu literaturu, nitko nije napravio ništa slično. Možda je u nekom drugom dijelu svijeta netko to pokušao napraviti pa nije uspio. Možda je netko i napravio, ali rad koji to opisuje nije objavljen. Ne znamo to, a ne testiramo li pretpostavku, nikad i nećemo doznati. Međutim, bilo bi ‘mrak’ da to radi – otkriva molekularna biologinja koja je cijeli radni vijek posvetila istraživanju adenovirusa, koje i rabi u testiranju metode.
Novac za sufinanciranje Majhen i Ristov pronašle su u programu HAMAG BICRO-a ‘Provjera inovativnog koncepta za poduzetnike’, također u programu PoC-u. BICRO u su radnji s prepoznatim centrima dodjeljuje nepovratna sredstva na konkurentnoj osnovi, odnosno najbolje ocijenjenim projektima do 70 posto ukupnih troškova projekta. PoC za poduzetnike ‘podupire pretkomercijalne aktivnosti u početnoj fazi razvoja novih proizvoda, usluga i tehnoloških procesa radi pružanja potpore u ranoj fazi razvoja inovacija kako bi se potpomogao i usmjerio daljnji razvoj te smanjio rizik investicije u kasnijoj fazi’, stoji u obrazloženju namjene programa kojemu je u konkretnom slučaju provedbena tijelo BioCentar, centar za biološka istraživanja u Kampusu Borongaj u Zagrebu.
Za projekt ‘Virus Hunter’ dobiven je velik novac koji omogućio dvjema znanstvenicama iz Instituta ‘Ruđer Bošković’ da istraže tu doista intrigantnu znanstvenu pretpostavku koja bi mogla biti ključem rješenja otkrivanja nepoznatih patogenih virusa. BioCentar im je na uporabu dao i svoje masene spektometre, bez kojih njihov rad ne bi bio moguć. Dakle, uspostavljena je praktična suradnja, dobiven novac za najosjetljiviju fazu projekta u nadi da će koncept biti točan. Prilika je to koju su znanstvenice čekale jer, kako kaže Majhen, vrlo se rijetko upravo znanstvenicima u Hrvatskoj pruža mogućnost sufinanciranja istraživanja, pogotovo kad ne znate unaprijed njihov rezultat.