Elektronički račun u Hrvatskoj prvi se put pravno izjednačio s računom na papiru donošenjem Izmjena i dopuna Pravilnika o porezu na dodanu vrijednost 2011., a dodatno su raspisani uvjeti izmjenom zakonske regulative 2013. Prema odredbama Zakona o porezu na dodanu vrijednost, računom se smatra račun izdan na papiru, ali i onaj izdan i poslan u elektroničkom obliku, no primatelj mora biti suglasan za prihvat tako izdanog računa. Bez obzira na to izdaje li se račun u elektroničkom obliku ili na papiru, mora se osigurati vjerodostojnost podrijetla, cjelovitost sadržaja i čitljivost računa. Propisana je obveza za poreznog obveznika utvrditi kako će osigurati vjerodostojnost podrijetla, cjelovitost sadržaja i čitljivost računa. Zakon o PDV-u propisuje da se to može ostvariti s pomoću elektroničke razmjene podataka (EDI) ili naprednoga elektroničkog potpisa ili bilo koje metode poslovne kontrole koja omogućuje povezivanje računa s isporukama dobara i usluga. Zakon o PDV-u propisuje da se vjerodostojnost podrijetla osigurava tako da se može nedvojbeno utvrditi identitet izdavatelja računa, a cjelovitost sadržaja treba osigurati tako da se sadržaj računa izmijeni do kraja razdoblja za pohranu računa.
Primjena naprednoga elektroničkog potpisa metoda je razmjene računa u elektroničkom obliku koja za zadovoljenje navedenih uvjeta rabi digitalni certifikat i napredni elektronički potpis koji to omogućuje. Vjerodostojnost podrijetla osigurava se tako da se može nedvojbeno utvrditi identitet izdavatelja računa. Može se osigurati uporabom digitalnih certifikata kojima se osigurava nedvojbeni autentičnost korisnika kao najsigurniji mehanizam dokaza identiteta. Cjelovitost sadržaja računa može se osigurati primjenom elektroničkog potpisa. On štiti integritet potpisanog sadržaja i dokument se nakon potpisa ne može mijenjati, odnosno svaka izmjena sadržaja na računu narušila bi elektronički potpis, što bi završilo pogreškom na računu. Poslovni subjekti mogu odabrati više informacijskih posrednika koji rade u skladu sa zakonskom regulativom za razmjenu elektroničkog računa. Odabir je dobrovoljan i na komercijalnoj osnovi te nema nikakvih uvjetovanja pri odabiru posrednika odluči li poslovni subjekt tako poslovati.
Finin e-Račun servis je za razmjenu elektroničkih računa internetom. Osim što je elektronička razmjena brža i sigurnija, taj servis omogućuje znatne uštede koje se odnose na troškove pripreme i slanja računa poput troškova papira, omotnica, tiska i poštanskih usluga. Najviše se štedi na troškovima obrade ulaznih računa koji podrazumijevaju skeniranje ulaznih računa i njihovo ručno prepisivanje u računovodstvene programe. Svi računi (poslani i primljeni) arhiviraju se u e-Arhivi u skladu sa Zakonom o računovodstvu, a uz račun se pohranjuju elektronički potpis i vremenski žig, što jamči integritet sadržaja računa i autentičnost pošiljatelja cijelo vrijeme pohrane računa. Servis e-Račun radi na tzv. zvjezdastome modelu razmjene računa, što znači da pošiljatelj i primatelj ne moraju potpisivati bilateralne ugovore za razmjenu računa; tako se zadovoljava zakonski uvjet da primatelj mora biti suglasan s primanjem računa. Prema tome je modelu dovoljna samo registracija na sustav. Korisnici se mogu registrirati samo za slanje, samo za primanje računa ili za oboje. Svaki pošiljatelj računa može razmjenjivati račune sa svim registriranim primateljima i obrnuto.
Vlada RH pokrenula je 2015. pilot-projekt da se osigura spremnost tijela javne vlasti za primitak računa u elektroničkom obliku. Svrha je toga projekta bila dokazati primjenjivost razmjene e-računa poslovnih subjekata i tijela državne uprave. Kako bi se potvrdile izvedivost zaprimanja elektroničkog računa u državnoj upravi te njihova pravna i tehnička ispravnost, zaposlenici su educirani o tome na primjeru stvarno poslanog i zaprimljenog računa u elektroničkom obliku. Na temelju rezultata pilot-projekta, kako bi se osigurala spremnost tijela državne uprave odnosno proračunskih korisnika državnog proračuna za primitak računa u elektroničkom obliku i daljnji razvoj elektroničkog poslovanja tijela državne uprave i poslovnih subjekata, donesena je odluka o zaprimanju strukturiranih računa u elektroničkom obliku i pratećih isprava za tijela državne uprave odnosno korisnika državnog proračuna. Budući da je e-račun najraširenija elektronička isprava u svijetu i ima središnju ulogu u razvoju elektroničkog poslovanja, njegovo je uvođenje zbog velike uštede vremena i novca u interesu velikih, srednjih i malih poduzeća te javnog sektora.
