Program je sto posto praktičan, znači nema ni jednog slajda prezentacije, već 40 sati vježbi, simulacija, primjera, grupnih rasprava, debata i alata za rad. Program Akademije traje pet dana i pokriva teme bitne za provedbu projekata, kao što su planiranje i koordinacija aktivnosti projekata, obveze korisnika, financijsko upravljanje, javna nabava itd. Program je namijenjen iskusnim voditeljima projekata EU i onima koji to žele postati. Na programu se dobiva primjer projekta EU na kojemu se tijekom programa simuliraju situacije kako bi polaznici iskusili provedbu i probali naći rješenje za izazove koji prate te projekte u provedbi.
Sa strane javne uprave problemi su u manjku vrlo kvalitetnoga kadra, slaboj koordinaciji među različitim tijelima, predugim rokovima u kojima se procesi odvijaju te nejasnoći strateškog pristupa i procedura za strukturne fondove kako bi se ostali sudionici na vrijeme pripremili. Sustav provedbe fondova EU u Hrvatskoj mlad je i ima prostora za rast i razvoj. Na strani korisnika, riječ je o nedostatku iskustva u vještinama potrebama za provedbu projekata, nedostatku vlastitih kapaciteta i sredstava koji podupiru projekte, ali isto tako u manjku sustavnog pristupa rješavanju problema sektora u kojima rade i dugoročnog planiranja.
Dva su razloga za povrat sredstava EU: nepotrošeno i pogrešno potrošeno. Sredstva se ne potroše prije svega zato što nije bilo dovoljno kvalitetnih projekata ili se nije na vrijeme ugovorila dovoljna količina projekata. S druge strane, korisnici preambiciozno planiraju projektne aktivnosti, koje ne stignu provesti u roku trajanja projekta. Najčešći razlozi za povrat su nevaljale javne nabave i nedokumentirani različiti troškovi. Pisanje projekata samo po sebi je jednostavno, može se napisati u nekoliko tjedana, ali ga nakon toga godinu do dvije treba provoditi. Svaki projektni prijedlog za sredstva EU u svojoj uspješnosti biva vrednovan ne u trenutku kada pobjedi na natječaju, nego kada se stvarno i provede i finalni izvještaj bude odobren. Projekti se ne razvijaju da bi dobili ugovor, nego da bi se proveli i potrošili sredstva. Iako to zvuči logično, velika većina korisnika ne obrazuje se za provedbu projekata, već samo za izradu tekstova projektnih prijedloga, koji kasnije lako ispadnu neizvedivi.