Da bi ispunila svoju funkciju, financiranje znanstvenih projekata kojim bi se potaknula obnova hrvatskoga gospodarstva, Hrvatskoj zakladi za znanost nedostaje 200 milijuna kuna.
Ne dobiće li novac od države, Hrvatska zaklada za znanost 2012. godine praktički će prestati postojati za nove projekte, što bi ugrozilo i nužna istraživanja za potrebe obnove gospodarstva. Do kraja ove, 2011. godine račun zaklade bit će ispražnjen, a da bi mogla funkcionirati kao što je zakonom propisano, potrebno joj je 200 milijuna kuna za financiranje od 10 do 20 posto prijavljenih projekata. Svrha postojanja zaklade jest povezivanje znanstvenih istraživanja i gospodarstva, kao i potpora znanstvenim istraživanjima koja mogu odgovoriti na potrebe gospodarstva, a Strateški plan zaklade jedna je od provedbenih mjera Plana gospodarskog oporavka Hrvatske.
Prema novom zakonu, zaklada postaje središnja ustanova za financiranje znanstvenih istraživanja. Treba financirati velike istraživačke projekte prema utvrđenim prioritetnim znanstvenim temama usklađenima s potrebama gospodarstva i europskog sustava znanosti. Promjenu zakona podržalo je i Nacionalno vijeće za znanost i Hrvatski sabor. No za takvu vrstu financiranja nedostaju potrebna sredstva jer su izdvajanja iz proračuna za zakladu beznačajna.
Upravni odbor čini maksimalne napore da osigura djelovanje u skladu novog Zakona o Hrvatskoj zakladi za znanost koji je donesen 2010. godine. To ponajprije znači osigurati sredstva za djelovanje zaklade kao glavnog mehanizma kompetitivnog financiranja znanosti u Hrvatskoj na osnovi triju načela: stroge međunarodne prosudbe projekata, izvrsnosti i usklađenosti s prioritetima razvoja države – kaže akademik Ivica Kostović, predsjednik Upravnog odbora Hrvatske zaklade za znanost.
Upravni odbor i stručnjaci zaklade razradili su Strateški plan rada za razdoblje od 2011. do 2015. godine kojim se definira plan rada, određuju se strateški prioriteti u financiranju i iskazuje namjera da se rad zaklade temelji na osiguravanju selekcije najboljih projekata na osnovi neovisne recenzije i profesionalno održane procedure vrednovanja i nadgledanja projekata. Početkom srpnja zaklada je raspisala natječaj za sedam programa financiranja znanstvenih istraživanja na koje očekuje velik odaziv: dva milijuna kuna za usavršavanje mladih znanstvenika u inozemstvu, tri milijuna kuna bit će usmjeren na osamostaljivanje mladih i uspješnih znanstvenika u Hrvatskoj, dok je za projekte suradnje znanosti i gospodarstva na raspolaganju 2,5 milijuna kuna. Iskusnim hrvatskim znanstvenicima za 28 istraživačkih projekata, koji će trajati tri godine, bit će dodijeljeno 30 milijuna kuna.
Odluka o financiranju projekata ovisit će isključivo o kvaliteti recenzije i procjeni prioriteta posve neovisnih, pretežito međunarodnih stručnjaka – objašnjava Kostović.
Koliko je ozbiljan problem financiranja zaklade pa time i znanstvenih projekata potvrđeno je i na nedavnoj konferenciji European Research Council, održanoj u Budimpešti, gdje je iznesen podatak o dokazanoj povezanosti nacionalnog ulaganja u znanost i broja ERC potpora. Prema tom podatku Hrvatska ne može povući znatna europska sredstva dok se ne povećaju nacionalna ulaganja u znanstvene projekte koji su prošli neovisnu i stručnu recenziju.
Znanstvenici su dobro upoznati s radom zaklade koja je svjetski model, ali građani, kao i većina subjekata u gospodarstvu, pod zakladem pogrešno podrazumijevaju još jedan odljev javnog novca ili,
Ulaganje gospodarstva u znanstvene projekte u Hrvatskoj daleko je ispod prosjeka Europske unije, pa je zaklada još 2006. pokrenula program Partnerstvo u istraživanjima da bi osigurala ulaganje gospodarstva u znanstvena istraživanja prema načelu jednakih uloga. Dosad je zaklada podržala 19 projekata u suradnji s industrijom i gospodarstvom. Uz ulaganja zaklade u iznosu od 13,5 milijuna kuna u temeljna istraživanja, koja su se provodila u hrvatskim znanstvenim ustanovama, privučeno je više od šest milijuna kuna iz sredstava izvan državnog proračuna jer se jedino partnerstvom i zajedničkim ulaganjima može ostvariti sinergija tih dvaju sektora te ojačati svijest o važnosti znanosti u razvitku gospodarstva i povećanju konkurentnosti u Hrvatskoj. No od osnutka Hrvatske zaklade za znanost nije bilo redovitih godišnjih izdvajanja novca iz državnog proračuna, iako je tako bilo zamišljeno. Zaklada je ostvarivala određene prihode oročavanjem sredstava koja su u njezin fond uplaćena još pri osnutku u 2002. i 2003. godini. No od 2004. godine, kad je Ministarstvo znanosti, obrazovanja i športa uplatilo iznos od gotovo 800 tisuća kuna, zaklada nije ostvarivala nikakve prihode iz državnog proračuna sve do 2009. i 2010. godine. Tada je ostvarila prihod od ukupno dva milijuna kuna, a milijun na godinu dovoljno za financiranje odlaska desetak mladih znanstvenika na usavršavanje u inozemstvo na godinu dana, odnosno za trogodišnje financiranje jednoga vrhunskog projekta renomiranog znanstvenika. Istodobno se posredstvom MZOŠ-a financira više od 2000 projekata bez novih natječaja s nedovoljnim iznosom pa zbog toga nema ni odgovarajućih znanstvenih i drugih rezultata.
Sigurno je da su svi sudionici Hrvatski sabor, Vlada RH, Hrvatska zaklada za znanost i svi znanstvenici, svjesni da ukupni iznos za znanstveno-istraživačke projekte treba vrednovati prema postotku izdvajanja iz nacionalnog bruto dohotka – kaže Kostović. Upravni odbor zato se zalaže da se na razini Vlade i Sabora točno dogovori koje od brojnih institucija i agencija trebaju financirati znanstvena i razvojna istraživanja kako bi se izbjeglo dvostruko financiranje izvan dogovorenih prioriteta i da bi zaklada dobila ključno mjesto u financiranju velikih istraživačkih projekata. Ako nema dodatnih mogućnosti u proračunu, potrebno je izvršiti preraspodjelu sredstava i povjeriti zakladi sredstva uz jamstvo da je riječ o financiranju izvrsnih projekata koji se uklapaju u potrebe gospodarstva i druge prioritete Hrvatske.