U proteklih šest godina u željeznički sustav uloženo je milijardu i tristo milijuna kuna. Novi investicijski ciklus predviđen Nacionalnim programom željezničke infrastrukture namijenio je čak četiri milijarde kuna za gradnju novih i dogradnju postojećih željezničkih pravaca do 2012. godine.
Ratni problemi, nedovoljno dobra organizacija željezničkog sustava te nedostatak kvalitetnih investicija u infrastrukturu opterećuju Hrvatske željeznice na putu da postanu preferirani prijevoznik za sve vrste tereta, a podjednaka je situacija i u putničkom prijevozu. U Nacionalnom programu željezničke infrastrukture za razdoblje od 2008. do 2012. godine, koji je upućen Hrvatskom saboru na prihvaćanje, predviđa se izrazito važan investicijski ciklus. Njime je predviđeno ulaganje od čak 18 milijardi kuna ili nešto više od dvije milijarde eura u razvoj Hrvatskih željeznica do 2012. godine. Sredstva za revitalizaciju željezničkih pravaca i prometa trebala bi biti realizirana većim dijelom iz proračuna, a iz pretpristupnih fondova EU namjerava se namaknuti manji dio u iznosu od milijardu kuna. U cijelini, riječ je o dosta velikom iznosu (za ilustraciju, u razdoblju od 2002. do 2006. godine uloženo je samo 1,3 milijarde kuna) koji bi, ako se pravilno utroši, trebao domaći željeznički promet uzdignuti na prijeratnu razinu te poduzeća u sustavu Hrvatskih željeznica napokon postaviti na mnogo zdravije poslovne noge. Kao jedno od najvažnijih postavlja se pitanje restrukturniranja sustava Hrvatskih željeznica koji zapošljava velik broj ljudi, a pojedini njegovi dijelovi jednostavno nisu u stanju poslovati na tržišnim principima.
