Hrvatska elektroprivreda veliku pozornost pridaje osiguranju kvalitete i upravljanju okolišem. Kako bi održavali i neprekidno poboljšavali vlastiti sustav kvalitete i upravljanja okolišem, u HEP-u su uvedeni međunarodni standardi, što potvrđuju brojni dobiveni certifikati.
Za sve hidroelektrane u sastavu HEP-a u Hrvatskoj ishoden su certifikati o proizvodnji električne energije iz obnovljivih izvora, čime se HEP Proizvodnja d.o.o. svrstava u velike certificirane proizvođače obnovljive energije u Europi.
Certifikat ISO 14001:2004 za upravljanje okolišem, ali i ISO 9001:2000 za upravljanje kvalitetom imaju proizvodni objekti i područja: najveća termoelektrana u Hrvatskoj Termoelektrana-toplana Zagreb, Proizvodno područje Sjever sa sve tri hidroelektrane na Dravi: HE Varaždin, HE Čakovec i HE Dubrava te Proizvodno područje Zapad sa svim pogonima hidroelektrana: Gojak, Vinodol, Rijeka, Senj i Ozalj.
U pogonima EL-TO Zagreb i KTE Jertovec obavljene su pripreme za njihovo uvođenje i certifikaciju, a slijedit će i certifikacija ostalih pogona HEP Proizvodnje d.o.o. U tijeku su aktivnosti na uvođenju Sustava upravljanja okolišem prema normi ISO 14001:2004 u HEP Operatoru prijenosnog sustava d.o.o. – Prijenosnom području Zagreb i HEP Operatoru distribucijskog sustava d.o.o. – Elektri Zagreb.
HEP je 2006. godine počeo investicijski ciklus gradnje elektrana. Svi novi pogoni gradit će se uz primjenu najsuvremenijih tehnologija zaštite okoliša koje osiguravaju poštovanje svih propisa EU u zaštiti okoliša. Uz pregovore Republike Hrvatske o pristupanju EU, HEP će i dalje promicati temeljne norme i vrijednosti EU na području energetike. To se prije svega odnosi na sigurnost opskrbe i rad prema načelima održivog i za okoliš prihvatljivog razvoja.
